Hřbitovní kostel sv. Jana Křtitele byl postaven koncem 16. století na předměstí tehdejšího města Horažďovice. Gotická stavba údajně navazovala na starší svatostánek stejného zasvěcení, jehož existence je dávána do souvislosti s působením Řádu maltézských rytířů.
Jednalo se o jednoduchou trojlodní stavbu s trojboce uzavřeným presbytářem. Stěny podpíraly mohutné opěráky a protínala je podélná, půlkruhem zaklenutá okna. V rámci přestavby v roce 1693 se z levé strany k presbytáři připojila sakristie. Prostory byly zaklenuty křížovými klenbami. Není zcela jisté, kdy byl kostel opatřen věží, neboť na nejstarším dochovaném vyobrazení z roku 1602 věž chybí. V interiéru pak můžeme najít zajímavou raně barokní kruchtu a cenným architektonickým dílem je také hrobka rodiny Majerovy. Dnes se kostel nachází v centru městského hřbitova nedaleko Červené brány.
